سان خوان عاصمة بورتوريكو وأكبر مدنها كما أنها أيضًا الميناء الرئيسي للجزيرة. عدد سكان المدينة 437,745 نسمة، أما منطقتها الحضرية فيبلغ عدد سكانها 1,086,376 نسمة. يقع الجزء القديم من المدينة في جزيرة تواجه الساحل الشمالي من بورتوريكو. وتقع المناطق السكنية الجديدة على الجزيرة الرئيسية وتترابط هذه الأجزاء من خلال 4 جسور وطريق فوق المياه.

تعتبر التجارة والصناعات والعمل بمؤسسات الحكومة من النشاطات الرئيسية بسان خوان. يرجع تاريخ بعض الحصون الأسبانية والجدران حول الأجزاء القديمة من المدينة إلى أكثر من 250 عاما، وتغطي المواقع التاريخية الوطنية بسان خوان مساحة تصل إلى 19,53 هكتار تحتوي على العديد من الحصون. ولقد بدأ بناء قلعة مورو عام 1539م واكتملت في أواخر القرن الثامن عشر، وهي تقع على منحدر في مدخل الخليج الذي يعتبر من أجمل المرافئ في جزر الهند الغربية. يوجد بسان خوان مركز للدراسات العليا لبورتوريكو والكاريبي كما توجد بها مساكن طلاب جامعة بورتوريكو، وفي المنطقة المجاورة توجد مباني جامعة تسمى القلب المقدس ومعهد الفنون الموسيقية لبورتوريكو. في عام 1521 أنشأ أتباع بونس دي ليون مدينة سان خوان واستُخدمت مقرًا للحكومة الأسبانية للمقاطعة.